Le département de médecine tropicale compte les services suivants :

  1. Parasitologie
  2. Entomologie.

Ce département dispose d’un laboratoire de biologie moléculaire moderne avec la possibilité de réaliser des séquençages des génomes. Grâce à ce laboratoire, on a pu identifier les variants delta du SARS-CoV2 chez plus de 80 % des patients hospitalisés pour Covid-19 aux CUK. Il avait été équipé grâce au ministère de la recherche.